Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

(Back to Minerals by class)

172 Malonic acid bis(isonicotinamide)

(Previous)     (Back)     (Next)
                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:    15.68  14.86  11.94  67.31  85.57  65.70   2332.7   1.488
                                       PM6:    14.65  14.68  12.25  65.81  81.84  68.78   2240.3   1.549
                 X-Ray                               PM6
 
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(1,1,1) GNORM=5
 Malonic acid bis(isonicotinamide)

  H         5.79409144 +1   13.5697363 +1   -0.1633141 +1                      0.0000
  C         1.64508359 +1   -8.2789259 +1   -1.4457001 +1                      0.0000
  H         1.88427901 +1   -7.9405175 +1   -2.4749986 +1                      0.0000
  C         0.88310673 +1   -9.4285635 +1   -1.2060558 +1                      0.0000
  H         0.52868810 +1  -10.0281396 +1   -2.0601022 +1                      0.0000
  C         0.60155994 +1   -9.8062386 +1    0.1144051 +1                      0.0000
  C         1.08449498 +1   -9.0184646 +1    1.1665920 +1                      0.0000
  H         0.86202087 +1   -9.2602436 +1    2.2269077 +1                      0.0000
  C         1.85704694 +1   -7.8888123 +1    0.8854288 +1                      0.0000
  H         2.28626732 +1   -7.2532011 +1    1.6989356 +1                      0.0000
  C        -0.19517859 +1  -11.0640476 +1    0.3546125 +1                      0.0000
  O        -0.51098285 +1  -11.8148763 +1   -0.5796602 +1                      0.0000
  N        -0.60568457 +1  -11.3430561 +1    1.6285141 +1                      0.0000
  H        -0.32985379 +1  -10.7845395 +1    2.4505777 +1                      0.0000
  H        -1.08011790 +1  -12.2346768 +1    1.8365689 +1                      0.0000
  N         2.12915832 +1   -7.5353477 +1   -0.4047830 +1                      0.0000
  N         2.54832804 +1    8.8818240 +1    2.0464222 +1                      0.0000
  C         3.03581664 +1    9.6153321 +1    3.0928519 +1                      0.0000
  H         2.79805590 +1    9.2657723 +1    4.1189205 +1                      0.0000
  C         3.79880434 +1   10.7668593 +1    2.8631665 +1                      0.0000
  H         4.15562646 +1   11.3573784 +1    3.7229051 +1                      0.0000
  C         4.07598376 +1   11.1579070 +1    1.5457331 +1                      0.0000
  C         3.58600439 +1   10.3825756 +1    0.4874634 +1                      0.0000
  H         3.80168370 +1   10.6380713 +1   -0.5708706 +1                      0.0000
  C         2.81519509 +1    9.2496614 +1    0.7587850 +1                      0.0000
  H         2.38471036 +1    8.6214980 +1   -0.0592991 +1                      0.0000
  C         4.87743577 +1   12.4144344 +1    1.3106091 +1                      0.0000
  O         5.17664075 +1   13.1741961 +1    2.2428910 +1                      0.0000
  N         5.31808103 +1   12.6782743 +1    0.0430518 +1                      0.0000
  H         5.05075605 +1   12.1169070 +1   -0.7804377 +1                      0.0000
  O         2.92097103 +1   -5.7502169 +1   -2.8883159 +1                      0.0000
  O         3.63511341 +1   -5.4631027 +1   -0.8179273 +1                      0.0000
  C         3.61477167 +1   -5.1281237 +1   -2.0618209 +1                      0.0000
  C         4.45492769 +1   -3.9428311 +1   -2.4571359 +1                      0.0000
  H         5.29421708 +1   -4.3037020 +1   -3.1027573 +1                      0.0000
  H         4.97358595 +1   -3.4909851 +1   -1.5795682 +1                      0.0000
  C         3.63285456 +1   -2.8917753 +1   -3.1560722 +1                      0.0000
  O         3.76928301 +1   -2.6339723 +1   -4.3600341 +1                      0.0000
  O         2.75552085 +1   -2.2628827 +1   -2.4391242 +1                      0.0000
  H         2.79349762 +1   -6.5774267 +1   -0.6169132 +1                      0.0000
  O         1.73759279 +1    7.1089635 +1    4.5232347 +1                      0.0000
  O         1.03454541 +1    6.8091905 +1    2.4512044 +1                      0.0000
  C         1.04849662 +1    6.4813602 +1    3.6966295 +1                      0.0000
  C         0.20965668 +1    5.2966628 +1    4.0978502 +1                      0.0000
  H        -0.63156375 +1    5.6595536 +1    4.7393063 +1                      0.0000
  H        -0.30699933 +1    4.8369110 +1    3.2230397 +1                      0.0000
  C         1.03613660 +1    4.2545406 +1    4.8051430 +1                      0.0000
  O         0.90054228 +1    3.9994535 +1    6.0092702 +1                      0.0000
  O         1.91915032 +1    3.6296301 +1    4.0904611 +1                      0.0000
  H         1.88526091 +1    7.9233476 +1    2.2511729 +1                      0.0000
  N         1.55147946 +1   -0.4331647 +1   -3.8515762 +1                      0.0000
  C         1.21614121 +1    0.6454991 +1   -3.0770870 +1                      0.0000
  H         1.45436794 +1    0.5981576 +1   -1.9944656 +1                      0.0000
  C         0.58909500 +1    1.7556701 +1   -3.6396020 +1                      0.0000
  H         0.30656052 +1    2.6070122 +1   -3.0076566 +1                      0.0000
  C         0.32038054 +1    1.7734962 +1   -5.0180179 +1                      0.0000
  C         0.69354230 +1    0.6821892 +1   -5.8042670 +1                      0.0000
  H         0.51091222 +1    0.6531078 +1   -6.8946451 +1                      0.0000
  C         1.29846315 +1   -0.4269864 +1   -5.1928809 +1                      0.0000
  H         1.56659147 +1   -1.3352689 +1   -5.7768880 +1                      0.0000
  C        -0.40777014 +1    2.9747666 +1   -5.5644910 +1                      0.0000
  O        -1.04996159 +1    3.7067531 +1   -4.7943974 +1                      0.0000
  N        -0.35076252 +1    3.2247637 +1   -6.9012350 +1                      0.0000
  H         0.14967579 +1    2.6256727 +1   -7.5733258 +1                      0.0000
  H        -0.86177704 +1    4.0216056 +1   -7.3144435 +1                      0.0000
  H         2.05059830 +1   -1.3471676 +1   -3.3349362 +1                      0.0000
  N         3.12639270 +1    1.7996433 +1    5.4910480 +1                      0.0000
  C         3.44192422 +1    0.7116473 +1    4.7215172 +1                      0.0000
  H         3.19790276 +1    0.7552278 +1    3.6397210 +1                      0.0000
  C         4.05994957 +1   -0.4020049 +1    5.2865843 +1                      0.0000
  H         4.32646107 +1   -1.2604389 +1    4.6568229 +1                      0.0000
  C         4.33944302 +1   -0.4148168 +1    6.6628847 +1                      0.0000
  C         3.98592853 +1    0.6863171 +1    7.4445277 +1                      0.0000
  H         4.17381602 +1    0.7194039 +1    8.5340886 +1                      0.0000
  C         3.39146095 +1    1.7997187 +1    6.8297830 +1                      0.0000
  H         3.14177076 +1    2.7165079 +1    7.4089035 +1                      0.0000
  C         5.05528999 +1   -1.6241766 +1    7.2083321 +1                      0.0000
  O         5.69747186 +1   -2.3573211 +1    6.4392114 +1                      0.0000
  N         4.97874621 +1   -1.8824888 +1    8.5423957 +1                      0.0000
  H         4.47791578 +1   -1.2791234 +1    9.2111304 +1                      0.0000
  H         5.47843595 +1   -2.6857272 +1    8.9570955 +1                      0.0000
  H         2.63252256 +1    2.7181988 +1    4.9742550 +1                      0.0000
  N        -6.07579809 +1   -7.7663813 +1   -0.7319805 +1                      0.0000
  C        -6.56586300 +1   -8.5259725 +1   -1.7595795 +1                      0.0000
  H        -6.34639270 +1   -8.1914213 +1   -2.7949446 +1                      0.0000
  C        -7.30875722 +1   -9.6830234 +1   -1.4983675 +1                      0.0000
  H        -7.67618326 +1  -10.2911184 +1   -2.3391075 +1                      0.0000
  C        -7.56474930 +1  -10.0563742 +1   -0.1703685 +1                      0.0000
  C        -7.08367703 +1   -9.2493611 +1    0.8662846 +1                      0.0000
  H        -7.29263289 +1   -9.4809744 +1    1.9325403 +1                      0.0000
  C        -6.33107256 +1   -8.1106627 +1    0.5640113 +1                      0.0000
  H        -5.90385612 +1   -7.4612407 +1    1.3677829 +1                      0.0000
  C        -8.34273750 +1  -11.3227670 +1    0.0940921 +1                      0.0000
  O        -8.80341657 +1  -11.9966337 +1   -0.8390384 +1                      0.0000
  N        -8.53278275 +1  -11.7095344 +1    1.3901128 +1                      0.0000
  O        -5.20537785 +1   -5.9653549 +1   -3.2074235 +1                      0.0000
  O        -4.55341322 +1   -5.6953184 +1   -1.1177535 +1                      0.0000
  C        -4.54960607 +1   -5.3354374 +1   -2.3542118 +1                      0.0000
  C        -3.72833189 +1   -4.1241504 +1   -2.7118857 +1                      0.0000
  H        -2.93421272 +1   -4.4386424 +1   -3.4322311 +1                      0.0000
  H        -3.16370363 +1   -3.7368315 +1   -1.8320213 +1                      0.0000
  C        -4.57598886 +1   -3.0131657 +1   -3.2821379 +1                      0.0000
  O        -4.43205446 +1   -2.7272698 +1   -4.5185642 +1                      0.0000
  O        -5.40018434 +1   -2.3916640 +1   -2.5725434 +1                      0.0000
  N        -6.08436524 +1   -0.7600408 +1   -5.1157761 +1                      0.0000
  C        -6.64228530 +1    0.0143328 +1   -4.1313582 +1                      0.0000
  H        -6.42012966 +1   -0.2593791 +1   -3.0790349 +1                      0.0000
  C        -7.44512091 +1    1.1100950 +1   -4.4594131 +1                      0.0000
  H        -7.86705463 +1    1.7320701 +1   -3.6556158 +1                      0.0000
  C        -7.68383906 +1    1.4108139 +1   -5.8091192 +1                      0.0000
  C        -7.13472909 +1    0.5886813 +1   -6.7969916 +1                      0.0000
  H        -7.31837982 +1    0.7651955 +1   -7.8771935 +1                      0.0000
  C        -6.32833749 +1   -0.4932903 +1   -6.4317024 +1                      0.0000
  H        -5.85273635 +1   -1.1541888 +1   -7.1969327 +1                      0.0000
  C        -8.51462879 +1    2.6202258 +1   -6.1600269 +1                      0.0000
  O        -9.18906084 +1    3.2139958 +1   -5.3067589 +1                      0.0000
  N        -8.49142906 +1    3.0486071 +1   -7.4575534 +1                      0.0000
  H        -8.19835871 +1  -11.1669301 +1    2.2009318 +1                      0.0000
  H        -9.05589647 +1  -12.5670514 +1    1.6204037 +1                      0.0000
  H        -7.96633241 +1    2.5727048 +1   -8.2040352 +1                      0.0000
  H        -9.05385163 +1    3.8559282 +1   -7.7642184 +1                      0.0000
  H        -5.41561378 +1   -6.8045879 +1   -0.9589579 +1                      0.0000
  H        -5.40254912 +1   -1.6333568 +1   -4.8396248 +1                      0.0000
  N        -1.47200003 +1    8.7635641 +1    1.6010136 +1                      0.0000
  C        -0.99786118 +1    9.5317047 +1    2.6296063 +1                      0.0000
  H        -1.22880362 +1    9.2025459 +1    3.6647332 +1                      0.0000
  C        -0.25490037 +1   10.6887165 +1    2.3706942 +1                      0.0000
  H         0.10214186 +1   11.3030453 +1    3.2111689 +1                      0.0000
  C         0.01558174 +1   11.0537459 +1    1.0430644 +1                      0.0000
  C        -0.45092222 +1   10.2400062 +1    0.0053473 +1                      0.0000
  H        -0.23222496 +1   10.4680014 +1   -1.0598034 +1                      0.0000
  C        -1.20258242 +1    9.1004116 +1    0.3058418 +1                      0.0000
  H        -1.61812151 +1    8.4457347 +1   -0.4993740 +1                      0.0000
  C         0.79397050 +1   12.3199576 +1    0.7809863 +1                      0.0000
  O         1.25478597 +1   12.9912404 +1    1.7160487 +1                      0.0000
  N         0.98245221 +1   12.7105158 +1   -0.5140091 +1                      0.0000
  O        -2.36525721 +1    6.9873334 +1    4.0886622 +1                      0.0000
  O        -2.99453144 +1    6.6975570 +1    1.9942179 +1                      0.0000
  C        -3.00956543 +1    6.3480601 +1    3.2334088 +1                      0.0000
  C        -3.82891659 +1    5.1364658 +1    3.5920269 +1                      0.0000
  H        -4.61970582 +1    5.4492501 +1    4.3166558 +1                      0.0000
  H        -4.39967764 +1    4.7509623 +1    2.7149237 +1                      0.0000
  C        -2.98091491 +1    4.0226786 +1    4.1564671 +1                      0.0000
  O        -3.13639268 +1    3.7270609 +1    5.3893409 +1                      0.0000
  O        -2.15082553 +1    3.4086378 +1    3.4475036 +1                      0.0000
  N        -1.48199559 +1    1.7698193 +1    5.9999139 +1                      0.0000
  C        -0.92114647 +1    0.9984859 +1    5.0149171 +1                      0.0000
  H        -1.14417039 +1    1.2726893 +1    3.9627371 +1                      0.0000
  C        -0.11277255 +1   -0.0934024 +1    5.3425814 +1                      0.0000
  H         0.31400487 +1   -0.7132645 +1    4.5394119 +1                      0.0000
  C         0.12566056 +1   -0.3959025 +1    6.6917674 +1                      0.0000
  C        -0.43018747 +1    0.4200792 +1    7.6811031 +1                      0.0000
  H        -0.24835380 +1    0.2417025 +1    8.7612214 +1                      0.0000
  C        -1.23897506 +1    1.5008373 +1    7.3151765 +1                      0.0000
  H        -1.71681679 +1    2.1591802 +1    8.0813070 +1                      0.0000
  C         0.96166027 +1   -1.6037900 +1    7.0358082 +1                      0.0000
  O         1.58358134 +1   -2.2324131 +1    6.1671321 +1                      0.0000
  N         1.01037025 +1   -1.9851126 +1    8.3465977 +1                      0.0000
  H         0.64752723 +1   12.1702353 +1   -1.3262033 +1                      0.0000
  H         1.50726139 +1   13.5671218 +1   -0.7428528 +1                      0.0000
  H         0.51417099 +1   -1.4887547 +1    9.1007553 +1                      0.0000
  H         1.56590299 +1   -2.7981306 +1    8.6495193 +1                      0.0000
  H        -2.13266050 +1    7.8020247 +1    1.8272044 +1                      0.0000
  H        -2.16808269 +1    2.6413658 +1    5.7231211 +1                      0.0000
  N        -2.01129512 +1   -7.7059274 +1   -0.3348139 +1                      0.0000
  C        -2.49396604 +1   -8.5490297 +1   -1.3008817 +1                      0.0000
  H        -2.26555671 +1   -8.3012652 +1   -2.3576266 +1                      0.0000
  C        -3.24240895 +1   -9.6734554 +1   -0.9449689 +1                      0.0000
  H        -3.59884908 +1  -10.3578285 +1   -1.7263214 +1                      0.0000
  C        -3.51875122 +1   -9.9277700 +1    0.4101416 +1                      0.0000
  C        -3.03222053 +1   -9.0510824 +1    1.3820125 +1                      0.0000
  H        -3.23019258 +1   -9.1996496 +1    2.4622064 +1                      0.0000
  C        -2.27132352 +1   -7.9448724 +1    0.9812462 +1                      0.0000
  H        -1.83667885 +1   -7.2324468 +1    1.7291883 +1                      0.0000
  C        -4.33105872 +1  -11.1503585 +1    0.7505131 +1                      0.0000
  O        -4.73378060 +1  -11.8997971 +1   -0.1534930 +1                      0.0000
  N        -4.63461469 +1  -11.4216033 +1    2.0525242 +1                      0.0000
  H        -5.19111024 +1  -12.2565343 +1    2.2928648 +1                      0.0000
  H        -4.34652645 +1  -10.8235611 +1    2.8435801 +1                      0.0000
  N         6.69575863 +1    9.0628162 +1    1.9983741 +1                      0.0000
  C         7.17662495 +1    9.9048955 +1    2.9663287 +1                      0.0000
  H         6.94107811 +1    9.6599528 +1    4.0226084 +1                      0.0000
  C         7.93157381 +1   11.0263171 +1    2.6140148 +1                      0.0000
  H         8.29030831 +1   11.7072228 +1    3.3972232 +1                      0.0000
  C         8.21351082 +1   11.2789712 +1    1.2597873 +1                      0.0000
  C         7.72974797 +1   10.4029500 +1    0.2860104 +1                      0.0000
  H         7.93282310 +1   10.5508554 +1   -0.7936955 +1                      0.0000
  C         6.96372830 +1    9.2993956 +1    0.6837943 +1                      0.0000
  H         6.53075932 +1    8.5892937 +1   -0.0670147 +1                      0.0000
  C         9.02941034 +1   12.4985430 +1    0.9185005 +1                      0.0000
  O         9.44514649 +1   13.2405852 +1    1.8231487 +1                      0.0000
  N         9.31954045 +1   12.7753880 +1   -0.3853686 +1                      0.0000
  H         9.87157214 +1   13.6129438 +1   -0.6279187 +1                      0.0000
  H         9.02162653 +1   12.1825311 +1   -1.1770370 +1                      0.0000
  O        -1.22061940 +1   -6.0450883 +1   -2.9512863 +1                      0.0000
  O        -0.48352176 +1   -5.6779889 +1   -0.9089611 +1                      0.0000
  C        -0.53085368 +1   -5.3739450 +1   -2.1586637 +1                      0.0000
  C         0.27509839 +1   -4.1843657 +1   -2.6175109 +1                      0.0000
  H         0.88319002 +1   -4.4775356 +1   -3.5085680 +1                      0.0000
  H         1.04129882 +1   -3.8899106 +1   -1.8637199 +1                      0.0000
  C        -0.59064001 +1   -2.9878985 +1   -2.9272074 +1                      0.0000
  O        -1.19651790 +1   -2.3526421 +1   -2.0401476 +1                      0.0000
  O        -0.67946916 +1   -2.6375029 +1   -4.1585971 +1                      0.0000
  H        -1.35344573 +1   -6.7681770 +1   -0.6396459 +1                      0.0000
  H        -1.52930767 +1   -1.5309135 +1   -4.2975286 +1                      0.0000
  O         5.92053206 +1    7.3916526 +1    4.6123780 +1                      0.0000
  O         5.16032309 +1    7.0416948 +1    2.5764596 +1                      0.0000
  C         5.21529776 +1    6.7314327 +1    3.8243572 +1                      0.0000
  C         4.39733810 +1    5.5521456 +1    4.2881187 +1                      0.0000
  H         3.79680705 +1    5.8500568 +1    5.1810376 +1                      0.0000
  H         3.61994593 +1    5.2687371 +1    3.5402750 +1                      0.0000
  C         5.25458180 +1    4.3475576 +1    4.5915782 +1                      0.0000
  O         5.87191968 +1    3.7225671 +1    3.7050801 +1                      0.0000
  O         5.32210703 +1    3.9800974 +1    5.8188881 +1                      0.0000
  H         6.03543159 +1    8.1272908 +1    2.3012769 +1                      0.0000
  H         6.18876989 +1    2.8805255 +1    5.9549547 +1                      0.0000
  N        -2.18871882 +1   -0.5887229 +1   -4.6436769 +1                      0.0000
  C        -2.73563194 +1    0.2762074 +1   -3.7349990 +1                      0.0000
  H        -2.56025099 +1    0.0799151 +1   -2.6581199 +1                      0.0000
  C        -3.48471195 +1    1.3770544 +1   -4.1625992 +1                      0.0000
  H        -3.90964125 +1    2.0646595 +1   -3.4177802 +1                      0.0000
  C        -3.68176032 +1    1.5906582 +1   -5.5365855 +1                      0.0000
  C        -3.13808801 +1    0.6861691 +1   -6.4524141 +1                      0.0000
  H        -3.28650026 +1    0.7942937 +1   -7.5466185 +1                      0.0000
  C        -2.38873789 +1   -0.3972780 +1   -5.9796826 +1                      0.0000
  H        -1.90355546 +1   -1.1183325 +1   -6.6807428 +1                      0.0000
  C        -4.48282728 +1    2.7928357 +1   -5.9658079 +1                      0.0000
  O        -5.06295228 +1    3.4977439 +1   -5.1253592 +1                      0.0000
  N        -4.56976807 +1    3.0823921 +1   -7.2972308 +1                      0.0000
  H        -4.11416527 +1    2.5223787 +1   -8.0311523 +1                      0.0000
  H        -5.09525353 +1    3.9026378 +1   -7.6325042 +1                      0.0000
  N         6.85241495 +1    1.9439857 +1    6.2966839 +1                      0.0000
  C         7.38813346 +1    1.0745770 +1    5.3858188 +1                      0.0000
  H         7.20453707 +1    1.2685384 +1    4.3102402 +1                      0.0000
  C         8.13490461 +1   -0.0296149 +1    5.8091189 +1                      0.0000
  H         8.54525870 +1   -0.7234804 +1    5.0607138 +1                      0.0000
  C         8.34604727 +1   -0.2392764 +1    7.1815563 +1                      0.0000
  C         7.81960344 +1    0.6741990 +1    8.0980984 +1                      0.0000
  H         7.98333625 +1    0.5722698 +1    9.1909275 +1                      0.0000
  C         7.06726820 +1    1.7576437 +1    7.6308850 +1                      0.0000
  H         6.59315212 +1    2.4839284 +1    8.3331789 +1                      0.0000
  C         9.13950451 +1   -1.4454299 +1    7.6144143 +1                      0.0000
  O         9.74852480 +1   -2.1352988 +1    6.7823594 +1                      0.0000
  N         9.18303794 +1   -1.7588495 +1    8.9427873 +1                      0.0000
  H         8.71026002 +1   -1.2098211 +1    9.6737285 +1                      0.0000
  H         9.70549436 +1   -2.5814379 +1    9.2781960 +1                      0.0000
 Tv         1.09250937 +1    5.5271664 +1   13.5234353 +1 
 Tv         5.67539703 +1   13.5385800 +1   -0.2354493 +1 
 Tv        12.22058648 +1    0.3327112 +1    0.7595600 +1